Le 21 mars 1963, la prison d'Alcatraz ferme définitivement ses portes après vingt-neuf années de service. On estime que la prison avait besoin d'un investissement de trois à cinq millions de dollars rien que pour sa restauration et sa maintenance afin qu'elle puisse continuer ses activités.
Cet investissement n'incluait pas les frais journaliers de fonctionnement d'Alcatraz qui étaient près de trois fois supérieurs à ceux des autres prisons fédérales. Ce surcoût exorbitant est en grande partie dû à l'isolement total de l'île qui impliquait que toutes les personnes et les marchandises soient acheminées par bateau. Ces marchandises sont non seulement des denrées alimentaires, des vêtements et du courrier, mais surtout de l'eau douce puisque Alcatraz n'avait aucune source. Ainsi chaque semaine, trois millions de litres d'eau doivent être apportés.
Le gouvernement fédéral a estimé alors qu'il était plus économique de construire une prison plus moderne plutôt que de rénover Alcatraz pour la garder en service.